糸球体に生じた炎症により起こる病気で、腎炎の95％以上を占めます。この背景には免疫の異常がありますが、発症原因はいまだ不明な点が多く残っています。原発性糸球体腎炎は症状が出にくく、血尿やたんぱく尿があってもごく微量で、発病後も良くなったり、悪くなったりを繰り返すケースも少なくありません。
原発性糸球体腎炎は症状によって、いくつかの病気に分類されます。また、腎臓の一部を採取して顕微鏡下で検査をおこなう腎生検（組織分類）によって、より細かく病気の確定を行い、病気の強さを判定し、その後の治療方針を決定し、予後の推定を行います。

IgA腎症は日本人に大変多く、原発性糸球体腎炎の一つで、その約40%を占めています。IgA（免疫グロブリンA）とは唾液、鼻汁、消化液などに分泌され、体外から異物が侵入するとき最も早く異物と反応する免疫に関与するたんぱく質の1つです。IgA腎症は、咽頭などに細菌感染が生じたあとにつくられたIgAが、何らかの原因で糸球体に付着して炎症を起こします。症状としては、目に見えない程度の血尿とたんぱく尿が特徴です。症状が進行するとネフローゼ症候群の症状がみられるようになります。
IgA腎症は、10～20年の経過で腎機能が低下する方もみられます。

全身の病気によって起こる腎臓病（糸球体疾患）を続発性糸球体疾患といいます。原因となる病気としては、膠原病（ループス腎炎、結節性多発動脈炎、ウェジナー肉芽腫など）、糖尿病性腎症などの代謝異常（糖尿病・アミロイドーシスなど）のほか、悪性腫瘍、薬による副作用、感染症、妊娠中毒症などがあります。次に代表的な病気について説明します。

ループス腎炎は全身性エリテマトーデス（SLE)という名前の病気（関節リウマチと同じ膠原病の一種）がもとで腎炎症状（たんぱく尿、血尿、むくみ、高血圧）が起こる病気です。20歳・30歳代の女性に多い病気です。かつてはSLEの患者さんでループス腎炎により腎不全となり亡くなるケースが多く、SLEの死因の第一位となっていましたが、現在は早期に薬物療法を行い症状の進行を抑えることができるようになりました。しかし、透析療法にまでいたるケースも少なくなく十分な注意が必要です。

結節性多発動脈炎、顕微鏡的多発性動脈炎は炎症により腎臓やその他臓器の中・小動脈の血管に壊死がみられる病気です。いずれも発熱、体重減少、関節痛、筋肉痛などで発症し、血尿やたんぱく尿があらわれて急激に腎機能が悪化します。血管の異常は全身にわたり、肺出血や神経炎、皮膚出血、消化管出血などもみとめます。

糖尿病の重大な合併症の１つで、続発性（二次性）糸球体疾患の代表的なものです。長く続いた高血糖によって腎臓の毛細血管がもろくなり、血液中のたんぱく質が外部に漏れてたんぱく尿が出るなど、最終的には尿をつくる機能が停止してしまいます。糖尿病では腎症を発症させないことが肝腎です。

腎硬化症は高血圧により腎臓が障害を受ける病気です。高血圧の既往の長い患者さんが健康診断で血尿を伴わない軽いたんぱく尿と腎機能障害を認めた場合、この病気がはじめに疑われます。この病気は高血圧が無治療で放置された結果、腎臓の細い動脈に強い動脈硬化が発症し少しずつ進行したもので、慢性腎不全の原因となっています。しかし、血圧のコントロールが良くなると他の腎臓病と比べてその進行スピードはゆっくりとなる場合も多くみられます。一方、悪性の高血圧の患者さんで、急激に血圧が上昇し、頭痛や吐き気が強く、意識障害がある場合には悪性腎硬化症という病気が疑われます。この場合は早急に透析が必要となります。

腎臓病のなかで大量のたんぱく尿が出るタイプのものを、ネフローゼ症候群といいます。子どもに多く発症することが知られていますが、大人にも発症します。ネフローゼ症候群では一般に腎生検によって細かく検査し病気の確定を行います。
ネフローゼ症候群のうち原発性（一次性）のものには、微小変化群と呼ばれるタイプや膜性腎症、巣状糸球体硬化症、膜性増殖性糸球体腎炎があります。
一方全身の病気によって糸球体に障害がおよぶ続発性（二次性）の疾患には、糖尿病性腎症、ループス腎炎（全身性エリテマトーデスを原因疾患とする腎障害）、関節リウマチ、腎アミロイドーシス、悪性腫瘍（がん）、妊娠中毒症、薬による副作用などがあります。
たんぱく尿のほかの症状としては、低たんぱく血症（血液中のたんぱく質が低下する状態）、高コレステロール血症、むくみ（浮腫）があり、泡状の尿や食欲不振、倦怠感、まぶたの浮腫、腹痛、下痢などが出ることもあります。
大量のたんぱく尿が長期間続くと腎機能が悪化するため、長期間にわたり尿たんぱくを減らす治療を続ける必要があります。また血管が詰まる血栓症を合併することもあります。

急性腎不全とは何らかの原因で腎臓のろ過能力が急激に減少し、それに伴い尿量が減ってしまう病気です。原因には脱水症状や多量の出血、心筋梗塞、腎毒性の強い薬による副作用、造影剤、心臓や腹部の大手術後、重症感染症、前立腺肥大症、卵巣癌、子宮癌などがあります。急性腎不全では、早期の治療で元どおりに回復する可能性があります。

慢性腎不全とは腎臓の機能が徐々に低下し、「尿をつくる装置」であるネフロンが破壊され、腎臓のろ過能力が正常時の30％以下となり、体内の正常な環境を維持できない状態をいいます。
とくにろ過能力が10％以下になると尿毒症になり、さまざまな症状が現れます。尿量は末期まで健康な人と同程度ですが、夜間に増えるのが特徴です。そして、最終的には尿量が減少し、乏尿になります。
この原因の代表的なものは、IgA腎症、糖尿病性腎症、高血圧性腎障害（腎硬化症）ですが、それ以外にも多発性嚢胞腎、慢性腎盂腎炎、ループス腎炎、急速進行性糸球体腎炎など、多くの原因疾患があります。
慢性腎不全は今のところ残念ながら完全に治すことができないので、透析療法や腎移植が必要になります。